"Casus uşaqlar" filmində Qreqorio (Gregorio) və İnqrid (Ingrid) Kortez (Cortez) dünyanın ən yaxşı casuslarıdır. Onlar ailə qurmaq və iki uşaq - Karmen (Carmen) və Cuniyoru (Juni) böyütmək üçün casusluq karyeralarını tərk edirlər. Lakin onların uşaqları valideynlərinin gizli keçmişindən xəbərsizdir.

Bir gün valideynlərini təqib edən düşmənlər onları oğurlayır. Uşaqlar valideynlərini xilas etmək üçün özləri casus olurlar. Onlar valideynlərinin gizli alət və geyimlərini istifadə edərək, dünyanı xilas etməyə çalışırlar.

Film, ailə, dostluq və sədaqət mövzularını birləşdirir. O, uşaqların özlərinin qəhrəman ola biləcəyini və böyüklərin də onlara güvənməsinin vacibliyini göstərir.