Filmin baş qəhrəmanı Tim Qudman (Tim Goodman) adlı 21 yaşlı gəncdir. Tim, uşaqlıqda atası ilə münasibətləri gərgin olduğu üçün Pokemonlarla dostluq etməkdən imtina edib. Ancaq atası - məşhur bir xəfiyyə - bir qəzada yoxa çıxanda Tim, onun sirli itkinliyini araşdırmaq üçün yola düşür.

Tədqiqatı zamanı Tim, Pikaçu ilə qarşılaşır. O, atası ilə birlikdə işləyən bir xəfiyyədir və Tim, onunla əlaqə qurmaq üçün danışmaq istəyir. Lakin Pikaçu, başqa Pokemonlar kimi deyil - o, zarafatcıl, iti ağıllı və hətta qəribə bir şəkildə Rayan Reynoldsun (Ryan Reynolds) səsinə malikdir.

Tim və Pikaçu birləşir, çünki ancaq onlar bir-birlərini başa düşə bilirlər. Onlar, Rimbik (Ryme City) şəhərinin küçələrində cinayətləri və sirli məlumatları araşdırarkən, Pikaçu ilə Tim dostluq qurur. Onlar, atalarının itkinliyinin arxasında daha böyük bir sirrin gizləndiyini kəşf edir və bütün Pokemon dünyasının gələcəyi üçün təhlükəli bir planı üzə çıxarmaq üçün birləşir.

Filmin əsas mövzuları dostluq, ailə, həqiqətin axtarışı və sevgidir. O, hər bir insanın içərisindəki gizli gücləri və qəhrəmanlığı göstərir.